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英国皇家植物园数字化了100万个标本,新数据将于秋季上线

编译Daisy 海洋与湿地
2024-08-11
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英国皇家植物园(邱园,RBG Kew)将其全部植物和真菌标本数字化,这是其使命中的一个重要里程碑。邱园的数字化项目已经扫描了第一百万个样本,这标志着一项雄心勃勃的四年计划取得了重大成就。这个耗资数百万英镑的项目背后的团队正在解开地球上生命的丰富信息,包括其他地方无法获得的罕见历史标本的数据。

(邱园数字化项目,图源:RBG Kew)

该项目始于2022年3月,正在对英国皇家植物园植物标本馆和真菌标本馆进行标本记录和扫描图像,以便世界任何地方的任何人都可以自由获取。科学家将能够通过一个预计将于秋季上线的新数据门户网站使用数字化标本来帮助研究。

该项目的植物和真菌标本数字存储库将为地球面临的一些重大挑战提供宝贵的见解,包括绘制单个物种的灭绝风险图,以及了解气候变化对生态系统、常见作物和当地社区的潜在影响。

邱园数字藏品研究负责人Sarah Phillips博士说:“我们拥有的每一个标本都有关键的数据,这些数据可以提供特定时间特定地点生长的植物的信息。这使我们能够监测特定地区植物分布随时间的变化,帮助我们了解地球的气候是如何变化的,以及如何适应以确保子孙后代的粮食安全。”

邱园的历史藏品被用来了解植物和真菌是如何随着环境条件和农业实践的变化而进化的,以确定可能在这一过程中失去的有用的遗传多样性。同样,研究人员正在以多种方式使用邱园和其他主要机构的数据,从揭示60%的野生咖啡物种面临灭绝的威胁,到绘制红木濒危物种的状况,再到了解不同文化中不同时期用于食物的很多豆类的变化。

邱园植物和真菌标本的数字化不仅对科学界很重要,对公众也很重要。它将允许任何有互联网连接的人访问这些标本的信息和图像,并更多地了解我们地球上令人难以置信的生命多样性。

邱园科学研究副主任Paul Kersey博士说,“实现这一里程碑是一项重大成就,证实了参与我们这个迄今为止最大项目的每个人的奉献精神和辛勤工作。最令人兴奋的是,我们已经意识到了这项工作的影响,研究人员积极利用我们的数字化藏品来应对我们地球今天面临的一些最大挑战。考虑到这一点,数字化我们收集的超过八百万个植物标本和真菌标本,其影响将是巨大的。”

(这是查尔斯·达尔文从詹姆斯岛的加拉帕戈斯采集的一个Phaseolus mollis Hook标本。图源:RBG Kew)

查尔斯·达尔文收集的样本

查尔斯·达尔文(Charles Darwin)在加拉帕戈斯群岛(Galapagos Islands)的开拓性探险中收集的非凡的Phaseolus mollis Hook现在是邱园数字化收藏的一部分。达尔文的标本有助于更深入地了解一些植物的进化史、生态关系以及独特的加拉帕戈斯群岛生态系统等地区的保护需求。以数字方式保存这件宝贵的植物文物,确保了后代能够获得它,增进了我们对达尔文科学遗产的了解,并激发了我们对自19世纪以来植物多样性如何变化的更多理解。

巨魔芋是世界上最臭的植物之一

巨魔芋被称为“尸花”,开花时有腐烂的肉的臭味,是一种极其罕见的植物。它起源于印度尼西亚苏门答腊岛的热带雨林,在那里它面临着栖息地的丧失和碎片化,这导致了它在野外的濒危状态。

该物种现在作为邱园数字藏品的一部分而永垂不朽,世界各地的研究人员很快就会接触到它。关于泰坦巨龙的数字化数据将推动研究工作,以了解其分类学、生态学和对环境变化的反应。此外,这些信息将有助于自然保护主义者确定需要保护的关键地区,实施保护措施,并保护其遗传多样性。

利用这些收藏品保护热带重要植物区(TIPA)并改善生计

邱园保护热带重要植物区(TIPA)的计划依赖于在踏入某个地区之前,使用植物标本馆的藏品首先对濒危物种进行地理定位。这项研究有助于为保护战略提供信息,并可以影响保护该地区免受森林砍伐等威胁的政策。

数字化邱园的藏品将使他们能够与世界各地的研究人员进行更大的全球合作,因为他们能够访问与植物标本馆标本一起存储的地理位置数据,从而使他们能够评估其在特定感兴趣地区的分布。这可能会加快通过保护评估和协助气候建模来解决生物多样性危机和气候变化的工作。

作为邱园玻利维亚TIPA项目的一部分,专家们一直在利用植物标本馆标本对受威胁物种和特有物种的位置进行地理定位。有了这些知识,该团队随后与当地社区合作,重点种植三种经济上有用的本地豆类物种,他们可以在当地森林完好无损的情况下可持续地种植这些物种。这个项目促使当地人建立了企业,创造了一个价值链,他们的产品销售到北美。

第一百万个标本——野韭(Allium ramosum)

这种非凡的植物坐落在庞大的收藏品中,是第一百万种需要数字化的植物,拥有丰富的植物学知识,等待着被揭开面纱。该物种通常被称为香蒜或韭菜,原产于中亚和俄罗斯远东地区。

通过仔细地成像和转录其附带的标签信息,邱园在数字领域为这个物种注入了生命。这一数字化努力的好处波及全球,为全世界的科学家提供了不受限制的获取这一宝贵资源的途径。从研究其复杂形态的分类学家到评估其分布模式的自然保护主义者,雷莫葱的数字记录是知识和灵感的灯塔,超越了地理界限。

一种已灭绝的物种Streblorhizo speciosa

邱园估计,五分之二的植物面临灭绝的风险,对于那些我们无法及时保护和拯救的物种来说,这是一个可悲的命运。现在,作为邱园收藏的一部分,Streblorhizo speciosa被数字化了,这是一种来自澳大利亚菲利普岛的多年生灌木,现在被认为已经在野外灭绝。邱园的研究人员正在与100多个国家的合作伙伴一起努力寻找基于自然的解决方案,以阻止生物多样性危机。通过数字化标本,邱园的历史藏品成为世界各地物种的时间胶囊。

标本之旅——数字化是如何运作的?

数字化官员从橱柜或压实机中收集样本,并将其送往附近的成像工作站。在那里,每个标本都有一个条形码,作为唯一的标识符,并拍摄标本的高分辨率照片以及保存标本的文件夹。

然后,这些图像被上传到软件平台,印度的数据输入团队在那里转录文件夹和标本上的书面信息。这通常包括标本是什么、谁采集的、在哪里采集的以及何时采集的。一旦邱园工作人员对图像和数据样本进行了质量检查,图像和数据就会从Max传输到邱园,并被纳入邱园的管理系统。一组内部数字化仪处理更复杂的标本,包括棕榈树和兰花,棕榈树往往又大又笨重,兰花经常在同一张纸上发现许多标本。数字化标本将通过2023年秋季发布的新数据门户网站免费提供给所有人。

(注:本文仅供资讯参考,不代表平台观点。)

原文链接:https://www.kew.org/about-us/press-media/digitisation-one-million

编译:Daisy  审核:Irene


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