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iNature：2018年3月1日，2个研究组同时在Nature发表研究论文，揭示儿童肿瘤的泛基因组学特征。由德国海德堡德国癌症研究中心的科学家领导的一个研究小组研究了代表24种不同类型癌症的961个肿瘤；另一个由田纳西州孟菲斯St Jude儿童研究医院的计算生物学家Jinghui Zhang带领，分析了6种癌症中的1,699个肿瘤，样本包括血液癌症，如白血病和实体瘤，如脑和骨骼中发现的那些。这俩篇论文的数据为儿童肿瘤提供了一个全面的基因组结构，并且强调了对儿童癌症特异性精确治疗的需求。另外，由于这俩篇文章具有开创性，Nature进行了专门的点评。

研究人员梳理了1700多种肿瘤的基因组，以代表超过20种不同类型的儿童癌症，挖掘潜在的药物靶点并更好地了解癌症在最年轻的患者中的表现。

这项由2月28日在Nature上发表的两个团队的工作是利用基因组学去解析儿童癌症的一部分。 在世界各地，研究人员将共同分享可用于研究这些疾病的基因组学数据，技术和细胞系。

这些努力产生了一系列可能在引发癌症中重要的遗传改变。 但是，要确定哪些遗传线索指向最佳药物靶点将需要大量工作。 “这不仅仅是通过基因组学数据挑选的问题，”华盛顿特区癌症倡导儿童事业发起人Susan Weiner说。 “目标的有效性也存在问题。”

在某些方面，这项工作对于儿童癌症研究比对成人癌症更容易：儿童肿瘤倾向于累积较少的突变，使得区分实际驱动肿瘤生长的遗传变化更容易。

但儿科癌症往往很少见，这意味着参加临床试验的患者较少，需要排序的肿瘤较少，并且较少的制药公司有兴趣为相对较小的市场创建药物。 韦纳说：“我们正在用成人药物开发药物。”

合作对抗癌症

为了提高他们挑选重要基因突变的能力，两组研究人员将他们的数据结合到了许多不同的肿瘤中。由德国海德堡德国癌症研究中心的科学家领导的一个研究小组研究了代表24种不同类型癌症的961个肿瘤。另一个由田纳西州孟菲斯St Jude儿童研究医院的计算生物学家Jinghui Zhang带领，分析了6种癌症中的1,699个肿瘤。样本包括血液癌症，如白血病和实体瘤，如脑和骨骼中发现的那些。

每项研究确定了140多个可能有助于驱动肿瘤生长的基因。 St Jude分析确定的基因中只有45％与成人肿瘤分析中发现的潜在癌症驱动因素相匹配。另一项研究估计，其中约一半的命中基因可能是有用的药物靶标。

这些发现可能导致检测其他基因在儿童癌症中的重要性，然后研究人员可以使用这些基因来选择合适的治疗方法。目前，这些测试通常筛选成人癌症中发现的突变，因此可能不包括特定于儿童肿瘤的突变。 “没有专门为小儿癌症开发的基因组，”Zhang说。

未来的目标

但从确定突变到开发有效药物还有很长的路要走。

马萨诸塞州波士顿Dana-Farber癌症研究所的小儿肿瘤学家Katherine Janeway说，确定这个短语的含义可能会很棘手。她说：“我们不知道哪些分子靶点与癌症儿童有关，这一数字很大。

但是，在Dana-Farber的儿科肿瘤学家斯科特·阿姆斯特朗说，在基因组学奠定坚实的基础是一个有益的开始。多个实验室正试图了解这种突变如何导致癌症。例如，麻省理工学院布罗德研究所和马萨诸塞州剑桥哈佛大学的一个大型项目正在使用基因组编辑工具系统研究儿科癌细胞的基因功能。

“这些研究将会非常有用，但它们不会成为故事的结尾，”阿姆斯特朗说。 “他们将成为了解正在发生的事情的开始。”

原文链接：

https://www.nature.com/articles/nature25795

https://www.nature.com/articles/nature25760

https://www.nature.com/articles/d41586-018-02359-6

https://www.nature.com/articles/d41586-018-01648-4

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