领域分析|40篇核心lncRNA文章系统分析（lncRNA大起底，中国表现出色，曹雪涛及陈玲玲各贡献1篇，值得收藏）
iNature：通过检索，我们发现总共有2383篇相关的lncRNA文章。总引用量是58768次，施引文章是16623篇；我们挑选了引用量最高的40篇文章，发现发现这40文章的引用量是21894次，占到全部lncRNA文章的引用率的47.87%，但是文章只是总文章的1.68%，说明这些文章非常的有影响力，故我们着重介绍这40篇文章。
1怎么找到长非编码RNA（lncRNA）
由于使用百度很难搜索到可靠的英文文章，故在这里，小编推荐使用雅虎搜索引擎，在搜索栏里面输入web of science这几个关键词，得到以下界面（图.1）。
图1. 网页的打开
再次，进入web of science网站（这个网站是要收费的，一般综合性大学及中科院会购买），得到了以下的界面（图.2）。
图2.Web of Science界面
在界面输入long noncoding RNA关键词，选项栏选择“标题”（图.3）。
图.3 搜索lncRNA文章
点击检索，能总共得到2383篇文章，这些文章都是高度同lncRNA相关。
22383篇文章的分析
对于这2383文章进行分析，我们发现总引用率是58768次，去除自引，有45734次，施引文章是16623篇，去除自引有14903篇（图.4）。
图.4 2383篇文章引用情况
我们再看一下，不同时间对于lncRNA的引用情况，发现2009年前，lncRNA非常低，但是2012年引用量是1909次，2013年引用量是3750次，2014年是6640次，2015年10066次，2016年是17210次，2017年17448次（图.5 ）。
图.5 2383篇文章不同时间段引用情况
之后我们看了引用率排名前40篇文章的引用情况，发现这40文章的总引用是21894次，去除自引是21739次，引用的文章达到9651篇（图.6）。
图.6 核心40篇文章引用情况
我们再看看这40篇文章各个时期的引用情况，我们发现2013年引用量为2302次，2014年3503次，2015年4029次，2016年5383次，2017年4400次（图.7）。
图.7 24篇文章不同时间段引用情况
非常的有趣，这40篇占到总引用率的47.87%，但是文章只是总文章的1.68%，说明这些文章非常的有影响力，故我们着重介绍这40篇文章。
340篇文章的分析
我们首先看了一下这40篇文章的类型，发现Article有24篇，review有16篇（图.8）。
图.8 40篇文章的类型
我们通过分析，美国占了22篇；中国及澳大利亚都是5篇；英国3篇；德国是2篇；意大利，西班牙及日本都是1篇（图.9）
图.9 40篇文章的国家分析
我们通过机构分析，发现斯坦福大学及哈佛大学都是有7篇文章；其次是澳大利亚昆士兰大学有5篇文章；第二军医大学4篇文章；牛津大学及冷泉港都是2篇，上海生科院1篇文章（图.10）。
图.10 40篇文章的大学或研究所分析（第一单位）
我们在统计了这24篇文章发在什么杂志上，非常的有趣，在Cell章居然达到了9篇；science是5篇；GENOME RESEARCH及MOLECULAR CELL都是4篇，CANCER RESEARCH是2篇；另外的文章发在其他杂志上，都是1篇，故就不再这里罗列了（图.11）。以上说明。Cell系列期刊比较偏爱lncRNA相关的文章，但是Nature发的比较少。
图.11 40篇文章所发杂志分析
我们在统计了这40篇文章发表的时间，发现在2010年以前，只有6篇；2011年居然达到了12篇；2012年有4篇；2013年有11篇；2014年2篇；2015年有1篇。所以，我们认为，对于lncRNA领域，主要兴起于2010年以后，这个从2383篇文章中，也有类似的规律（图.12）。
图.12 40篇文章发表时间统计
最后我们统计了通讯作者，发现Chang Howard（张元豪） 有9篇；Lee Jeannie 及Mattick John有4篇；第二军医大学的孙树汗是3篇；Dinger Marcel ，Ponting Chris及Spector David 都是2篇。另外提一下，曹雪涛及陈玲玲都是1篇。
440篇文章列表
红色标记的是review，绿色的是Editorial Material。
Evolution and Functions of Long Noncoding RNAs;
The GENCODE v7 catalog of human long noncoding RNAs: Analysis of their gene structure, evolution, and expression；
Long Noncoding RNA as Modular Scaffold of Histone Modification Complexes；
Genome Regulation by Long Noncoding RNAs；
Molecular Mechanisms of Long Noncoding RNAs；
A Long Noncoding RNA Controls Muscle Differentiation by Functioning as a Competing Endogenous RNA；
Long noncoding RNAs: functional surprises from the RNA world；
Long Noncoding RNAs with Enhancer-like Function in Human Cells；
A long noncoding RNA maintains active chromatin to coordinate homeotic gene expression
Long noncoding RNAs and human disease；
Long Noncoding RNA HOTAIR Regulates Polycomb-Dependent Chromatin Modification and Is Associated with Poor Prognosis in Colorectal Cancers；
Specific expression of long noncoding RNAs in the mouse brain；
Long Noncoding RNAs: Cellular Address Codes in Development and Disease；
Epigenetic Regulation by Long Noncoding RNAs；
Genomic Maps of Long Noncoding RNA Occupancy Reveal Principles of RNA-Chromatin Interactions；
Structure and function of long noncoding RNAs in epigenetic regulation；
Long noncoding RNAs in mouse embryonic stem cell pluripotency and differentiation；
A Long Noncoding RNA Activated by TGF-beta Promotes the Invasion-Metastasis Cascade in Hepatocellular Carcinoma；
Long Noncoding RNAs: Past, Present, and Future；
Braveheart, a Long Noncoding RNA Required for Cardiovascular Lineage Commitment；
No-Nonsense Functions for Long Noncoding RNAs；
The landscape of long noncoding RNAs in the human transcriptome；
Vernalization-Mediated Epigenetic Silencing by a Long Intronic Noncoding RNA（植物）；
Functionality or transcriptional noise? Evidence for selection within long noncoding RNAs；
Long Noncoding RNA High Expression in Hepatocellular Carcinoma Facilitates Tumor Growth Through Enhancer of Zeste Homolog 2 in Humans；
Long Intergenic Noncoding RNAs: New Links in Cancer Progression；
Systematic identification of long noncoding RNAs expressed during zebrafish embryogenesis；
3 ' End Processing of a Long Nuclear-Retained Noncoding RNA Yields a tRNA-like Cytoplasmic RNA；
X-Inactivation, Imprinting, and Long Noncoding RNAs in Health and Disease；
lncRNAdb: a reference database for long noncoding RNAs（第一个预测lncRNA数据库）；
A Long Noncoding RNA Mediates Both Activation and Repression of Immune Response Genes;
The Long Noncoding MALAT-1 RNA Indicates a Poor Prognosis in Non-small Cell Lung Cancer and Induces Migration and Tumor Growth;
Long Noncoding RNA MALAT1 Controls Cell Cycle Progression by Regulating the Expression of Oncogenic Transcription Factor B-MYB;
Long noncoding RNAs and the genetics of cancer;
The STAT3-Binding Long Noncoding RNA lnc-DC Controls Human Dendritic Cell Differentiation;
Repression of the Long Noncoding RNA-LET by Histone Deacetylase 3 Contributes to Hypoxia-Mediated Metastasis;
The Long Noncoding RNA, Jpx, Is a Molecular Switch for X Chromosome Inactivation;
Circular Intronic Long Noncoding RNAs;
Long noncoding RNA in genome regulation Prospects and mechanisms;
MALAT1- a paradigm for long noncoding RNA function in cancer.
注意：所有的数据都是来源于Web of Science，如需要这40篇文章，可在后面留言。
致谢：感谢陈玲玲组的邢宇航博士对于这篇文章的校正，另外，对于第38文章，是涉及环状RNA，也是lncRNA的一类，同时也是为了引出下一次要讲的环状RNA。
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